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学术报告
植物保护学院青年教师创新沙龙(第31期)
发布日期:2020-11-10 浏览次数: 信息来源:植保学院 字号:[ ]

题目Bumble bee genomes: what are boring, interesting and promising

时间2020-11-26(周四)下午300-600

地点:新植保楼3060A 会议室

报告人:孙成博士,中国农业科学院蜜蜂研究所研究员、博士生导师。

孙成研究员于2009年博士毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,20092月至20158月先后在美国德克萨斯大学阿灵顿分校、科罗拉多州立大学做博士后研究。201510月入选中国农业科学院“青年英才计划”引进人才,到蜜蜂研究所工作,主要从事熊蜂进化与功能基因组学研究。近5年在我国本土熊蜂基因组解析、基因调控区域注释、熊蜂基因及基因组进化的分子机制方面取得了一系列进展。目前以第一或通讯作者身份在Molecular Biology and EvolutionBMC BiologyScientific DataGenome Biology and EvolutionBMC Genomics等国际重要刊物上发表论文10余篇,文章被Nature Reviewers GeneticsF1000等作为研究亮点进行评述。

近年来代表性论文

1) Sun C*, Huang J, Wang Y, Zhao X, Su L, Thomas GWC, Zhao M et al. 2020. Genus-wide characterization of bumblebee genomes provides insights into their evolution and variation in ecological and behavioral traits. Molecular Biology and Evolution. msaa240. (https://doi.org/10.1093/molbev/msaa240). Highlighted in Nature Reviews Genetics (https://doi.org/10.1038/s41576-020-00294-9).

2) Zhao X, Su L, Xu W, Schaack S, Sun C*. 2020. Genome-wide identification of accessible chromatin regions in bumblebee by ATAC-seq. Scientific Data. 7: 367.

3) Zhao X, Su L, Schaack S, Sadd BM, Sun C*. 2018. Tandem repeats contribute to coding sequence variation in bumblebees (Hymenoptera: Apidae). Genome Biology and Evolution 10(12):3176–3187.

4) Sun C, Feschotte C, Wu Z, Mueller RL. 2015. DNA transposons have colonized the genome of the giant virus Pandoravirus salinus. BMC Biology. 13(1): 38.

5) Sun C, Mueller RL. 2014. Hellbender genome sequences shed light on genomic expansion at the base of crown salamanders. Genome Biology and Evolution. 6(7): 1818-1829.  

  1. Sun C, Wyngaard G, Walton DB, Wichman HA, Mueller RL. 2014. Billions of basepairs of recently expanded, repetitive sequences are eliminated from the somatic genome during copepod development. BMC Genomics. 15(1): 186. 

  2. Sun C, López Arriaza JR, Mueller RL. 2012. Slow DNA loss in the gigantic genomes of salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(12): 1340-1348.

    (F1000 recommendation: http://f1000.com/prime/718020336)

  3. Sun C, Shepard DB, Chong RA, López Arriaza J, Hall K, Castoe TA, Feschotte C, Pollock DD, Mueller RL. 2012. LTR retrotransposons contribute to genomic gigantism in plethodontid salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(2): 168–183.

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